Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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