Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms