Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms