Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms