Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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