Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.26-201ENST00000547793 284 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC090371.1-201ENST00000580071 558 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC092720.1-201ENST00000562466 447 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms