Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms