Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms