Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTRA4P83105 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HTRA4P83105 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms