Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA4AP68366 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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