Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms