Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms