Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms