Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPD2P43304 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPD2P43304 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPD2P43304 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms