Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXD13P35453 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD13P35453 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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