Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCAP28676 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCAP28676 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms