Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms