Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms