Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK11BP21127 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK11BP21127 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms