Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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