Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.5 ms