Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOT1P17174 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GOT1P17174 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms