Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRT10P13645 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRT10P13645 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT10P13645 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT10P13645 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT10P13645 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT10P13645 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT10P13645 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRT10P13645 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms