Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms