Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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