Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms