Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN9O95484 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN9O95484 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN9O95484 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms