Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CCNDBP1O95273 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CCNDBP1O95273 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CCNDBP1O95273 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CCNDBP1O95273 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNDBP1O95273 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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