Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms