Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP290O15078 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP290O15078 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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