Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms