Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms