Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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