Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVV-1B6SEH8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms