Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF879B4DU55 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms