Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms