Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ISM1B1AKI9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms