Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC45.26■■■■■ 4.84
DCAF1Q9Y4B6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.25■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC45.22■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
DCAF1Q9Y4B6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
DCAF1Q9Y4B6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC45.12■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms