Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNRF3Q9ULT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNRF3Q9ULT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNRF3Q9ULT6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNRF3Q9ULT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms