Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PADI1Q9ULC6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI1Q9ULC6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI1Q9ULC6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms