Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH9Q9ULB4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH9Q9ULB4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH9Q9ULB4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms