Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCNL1Q9UK58 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCNL1Q9UK58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCNL1Q9UK58 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCNL1Q9UK58 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNL1Q9UK58 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNL1Q9UK58 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms