Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCM8Q9UJA3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM8Q9UJA3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCM8Q9UJA3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms