Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA4Q9UI42 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA4Q9UI42 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPA4Q9UI42 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms