Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPS7AQ9UBW8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS7AQ9UBW8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS7AQ9UBW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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