Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-18Q9QC07 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-18Q9QC07 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-18Q9QC07 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms