Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL42Q9P2K6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL42Q9P2K6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL42Q9P2K6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms