Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CC2D2AQ9P2K1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CC2D2AQ9P2K1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CC2D2AQ9P2K1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC42.57■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC42.57■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms