Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177 ms