Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCH5Q9NX47 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MARCH5Q9NX47 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MARCH5Q9NX47 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH5Q9NX47 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH5Q9NX47 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms